如何在创建环境时将.conda 从一个文件夹移动到另一个文件夹

2024-10-28 08:37:00
admin
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摘要:问题描述:我必须连接到一个服务器,我的用户可以访问一个小分区,在/home/users/user_name这个分区中我有一个有限的空间配额和一个更大的分区/big_partition/users/user登录该服务器后,我将到达/home/users/user_name大本营。之后,我将执行以下步骤。cd /...

问题描述:

我必须连接到一个服务器,我的用户可以访问一个小分区,在/home/users/user_name这个分区中我有一个有限的空间配额和一个更大的分区/big_partition/users/user

登录该服务器后,我将到达/home/users/user_name大本营。之后,我将执行以下步骤。

  1. cd /big_partition/users/user

  2. create conda --prefix=envs python=3.6

第四行说的Package plan for installation in environment /big_partition/users/user/envs:是没问题。

  1. y,但我没有收到以下消息。

OSError: [Errno 122] Disk quota exceeded: '/home/users/user_name/.conda/envs/.pkgs/python-3.6.2-0/lib/python3.6/unittest/result.py'

有人能帮助我理解当我创建这个环境时如何将.conda文件夹从移动/home/users/user_name到吗?/big_partition/users/user


解决方案 1:

配置环境和包默认位置

我猜,尽管你努力将环境放在大分区上,但仍然有一个默认的用户级包缓存,它正在填满主分区。至少,在大分区上设置一个新的包缓存和一个默认的环境目录:

# create a new pkgs_dirs (wherever, doesn't have to be hidden)
mkdir -p /big_partition/users/user/.conda/pkgs

# add it to Conda as your default
conda config --add pkgs_dirs /big_partition/users/user/.conda/pkgs

# create a new envs_dirs (again wherever)
mkdir -p /big_partition/users/user/.conda/envs

# add it to Conda as your default
conda config --add envs_dirs /big_partition/users/user/.conda/envs

现在您不必--prefix再为使用标志而烦恼了 - 您的命名环境(conda create -n foo)将默认在此目录内创建,并且您可以通过名称而不是目录(conda activate foo)来激活。

转移以前的环境和包缓存

不幸的是,没有一种很好的方法可以在不破坏硬链接的情况下跨文件系统移动 Conda 环境。相反,您需要重新创建环境。由于您可能不想为此烦恼,所以我只打算概述一下。如果需要,我可以详细说明。

  1. 存档环境。使用conda env export -n foo > foo.yaml(每个环境一个。)

  2. 移动程序包缓存。将旧程序包缓存的内容 ( /home/users/user_name/.conda/envs/.pkgs/) 复制到新程序包缓存。

  3. 重新创建环境。使用conda env create -n foo -f foo.yaml

再次强调,您可以完全跳过这一步。这主要是因为如果您希望彻底完成传输,而不必为已创建的环境重新下载内容。

此后,您可以删除旧文件夹下的一些内容~/.conda/envs/pkgs

解决方案 2:

我找到了解决方案。我需要做的就是导出 CONDA_ENVS_PATH,其中包含我想要的路径.conda

export CONDA_ENVS_PATH=.

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