可以使用相同的输入文件作为管道命令的输出吗？

问题描述：

考虑一下这样的事情：

cat file | command > file

这是好的做法吗？这是否可以在我们读取输入文件的同时覆盖它，还是总是先在内存中读取，然后通过管道传输到第二个命令？

显然，我可以使用临时文件作为中间步骤，但我只是想知道......

t=$(mktemp)
cat file | command > ${t} && mv ${t} file

解决方案 1：

不可以。管道中的所有命令同时执行，并且 shell 在执行命令之前会准备重定向。因此，命令很可能会在 cat 读取文件之前覆盖该文件。

您需要moreutils 的sponge(1)。

解决方案 2：

您也可以使用类似这样的方法（不推荐，在生产代码中使用明确的临时文件）：

{ rm file && your_command > file; } < file

解决方案 3：

您不仅不应该将输出写入输入，还应该避免将输出循环回输入。

在处理大文件时，我尝试过

    cat *allfastq30 > Sample_All_allfastq30

并生成错误消息：

    cat: Sample_All_allfastq30: input file is output file