在Linux下限制R的内存使用量

问题描述：

我们在 Linux 集群环境中运行 R。当用户无意中使用 R 进程占用所有内存时，头节点会出现几次挂起。有没有办法在 Linux 下限制 R 内存使用量？我宁愿不建议使用全局 ulimit，但这可能是唯一的出路。

解决方案 1：

它允许使用与shell 中相同的机制为正在运行的 R 进程设置内存限制。不支持unix::rlimit_as()Windows和macOS 。ulimit

在我的.Rprofile我有

unix::rlimit_as(1e12, 1e12)

将内存使用量限制为~12 GB。

在此之前...

我创建了一个ulimit具有类似功能的小型 R 包。

使用以下方式从 GitHub 安装

devtools::install_github("krlmlr/ulimit")

要将 R 可用的内存限制为 2000 MiB，请调用：

ulimit::memory_limit(2000)

现在：

> rep(0L, 1e9)
Error: cannot allocate vector of size 3.7 Gb

解决方案 2：

?"Memory-limits"建议使用ulimit或limit。

有一个命令行标志：--max-mem-size可以设置初始限制。用户可以在会话期间使用 来增加该限制memory.limit。