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如何分割文件并保留每个部分的第一行？

2024-11-12 08:36:00
admin
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摘要：问题描述：给定：一个具有“特殊”第一行（例如字段名称）的大型文本数据文件（例如 CSV 格式）。想要： coreutils 命令的等效命令split -l，但另外要求原始文件的标题行出现在每个结果片段的开头。我猜想某种混合物split会head起作用？解决方案 1：这是经过稍微清理的robhruska脚本：t...

问题描述：

给定：一个具有“特殊”第一行（例如字段名称）的大型文本数据文件（例如 CSV 格式）。

想要： coreutils 命令的等效命令split -l，但另外要求原始文件的标题行出现在每个结果片段的开头。

我猜想某种混合物split会head起作用？

解决方案 1：

这是经过稍微清理的robhruska脚本：

tail -n +2 file.txt | split -l 4 - split_
for file in split_*
do
    head -n 1 file.txt > tmp_file
    cat "$file" >> tmp_file
    mv -f tmp_file "$file"
done

我删除了不必要的地方的 、 和wc。cut我更改了一些文件名，使它们更有意义。我将其分成多行只是为了让它更容易阅读。ls`echo`

如果您想要更高级的功能，您可以使用mktemp或tempfile创建一个临时文件名，而不是使用硬编码的文件名。

编辑

使用 GNUsplit可以做到这一点：

split_filter () { { head -n 1 file.txt; cat; } > "$FILE"; }; export -f split_filter; tail -n +2 file.txt | split --lines=4 --filter=split_filter - split_

为了便于阅读，分解如下：

split_filter () { { head -n 1 file.txt; cat; } > "$FILE"; }
export -f split_filter
tail -n +2 file.txt | split --lines=4 --filter=split_filter - split_

当--filter指定时，split为每个输出文件运行命令（在本例中为函数，必须导出），并将FILE命令环境中的变量设置为文件名。

过滤脚本或函数可以对输出内容甚至文件名进行任何操作。后者的一个例子可能是输出到变量目录中的固定文件名：> "$FILE/data.dat"例如。

解决方案 2：

此行代码将把大 csv 拆分成 999 条记录，并保留每条记录顶部的标题行（因此 999 条记录 + 1 个标题 = 1000 行）

cat bigFile.csv | parallel --header : --pipe -N999 'cat >file_{#}.csv'

根据 Ole Tange 的回答。

请参阅评论以获取有关安装并行的一些提示

解决方案 3：

您可以使用 GNU coreutils split >= 8.13 (2011) 中的新 --filter 功能：

tail -n +2 FILE.in | split -l 50 - --filter='sh -c "{ head -n1 FILE.in; cat; } > $FILE"'

解决方案 4：

您可以使用[mg] awk：

awk 'NR==1{
        header=$0; 
        count=1; 
        print header > "x_" count; 
        next 
     } 

     !( (NR-1) % 100){
        count++; 
        print header > "x_" count;
     } 
     {
        print $0 > "x_" count
     }' file

100 是每个切片的行数。它不需要临时文件，可以放在一行上。

解决方案 5：

我对 Bash-fu 还只是个新手，但我能够编写出这个只有两个命令的怪物。我相信还有更优雅的解决方案。

$> tail -n +2 file.txt | split -l 4
$> for file in `ls xa*`; do echo "`head -1 file.txt`" > tmp; cat $file >> tmp; mv -f tmp $file; done

这是假设您的输入文件是file.txt，您没有使用 的prefix参数split，并且您正在一个目录中工作，该目录中没有任何其他以 的split默认xa*输出格式开头的文件。此外，将“4”替换为您所需的分割线大小。

解决方案 6：

使用 GNU Parallel：

parallel -a bigfile.csv --header : --pipepart 'cat > {#}'

如果您需要对每个部分运行一个命令，那么 GNU Parallel 也可以帮助您做到这一点：

parallel -a bigfile.csv --header : --pipepart my_program_reading_from_stdin
parallel -a bigfile.csv --header : --pipepart --fifo my_program_reading_from_fifo {}
parallel -a bigfile.csv --header : --pipepart --cat my_program_reading_from_a_file {}

如果您想要将每个 CPU 核心分成 2 个部分（例如 24 个核心 = 48 个大小相等的部分）：

parallel --block -2 -a bigfile.csv --header : --pipepart my_program_reading_from_stdin

如果要拆分成 10 MB 的块：

parallel --block 10M -a bigfile.csv --header : --pipepart my_program_reading_from_stdin

解决方案 7：

下面是一个 4 行代码，可用于将 bigfile.csv 拆分为多个较小的文件，并保留 csv 标头。仅使用内置 Bash 命令（head、split、find、grep、xargs 和 sed），这些命令应适用于大多数 *nix 系统。如果您安装了 mingw-64 / git-bash，也应适用于 Windows。


csvheader=`head -1 大文件.csv`
split -d -l10000 bigfile.csv smallfile_
查找 .|grep smallfile_ | xargs sed -i "1s/^/$csvheader
/"
sed -i ‘1d’ smallfile_00

逐行解释：

  1. 将标头捕获到名为csvheader的变量中

  2. 将bigfile.csv拆分为多个以smallfile_为前缀的小文件

  3. 查找所有小文件并使用xargs和sed -i将 csvheader 插入第一行。请注意，您需要在“双引号”内使用 sed 才能使用变量。

  4. 第一个名为 smallfile_00 的文件现在在第 1 行和第 2 行有冗余标头（来自原始数据以及第 3 步中的 sed 标头插入）。我们可以使用 sed -i '1d' 命令删除冗余标头。

解决方案 8：

这是Denis Williamson脚本的更强大版本。该脚本会创建大量临时文件，如果运行不完整，这些文件就被遗弃了，这真是太可惜了。因此，让我们添加信号捕获（请参阅http://tldp.org/LDP/Bash-Beginners-Guide/html/sect_12_02.html和http://tldp.org/LDP/abs/html/debugging.html）并删除临时文件；无论如何，这都是最佳做法。

trap 'rm split_* tmp_file ; exit 13' SIGINT SIGTERM SIGQUIT 
tail -n +2 file.txt | split -l 4 - split_
for file in split_*
do
    head -n 1 file.txt > tmp_file
    cat $file >> tmp_file
    mv -f tmp_file $file
done

将“13”替换为您想要的任何返回代码。哦，无论如何，您可能都应该使用 mktemp（正如一些人已经建议的那样），因此继续从陷阱行中的 rm 中删除“tmp_file”。请参阅信号手册页以了解更多要捕获的信号。

解决方案 9：

我喜欢 awk 版本的 marco，它采用了简化的单行代码，您可以在其中轻松指定所需的分割分数：

awk 'NR==1{print $0 > FILENAME ".split1";  print $0 > FILENAME ".split2";} NR>1{if (NR % 10 > 5) print $0 >> FILENAME ".split1"; else print $0 >> FILENAME ".split2"}' file

解决方案 10：

我真的很喜欢 Rob 和 Dennis 的版​​本，所以我想改进它们。

这是我的版本：

in_file=$1
awk '{if (NR!=1) {print}}' $in_file | split -d -a 5 -l 100000 - $in_file"_" # Get all lines except the first, split into 100,000 line chunks
for file in $in_file"_"*
do
    tmp_file=$(mktemp $in_file.XXXXXX) # Create a safer temp file
    head -n 1 $in_file | cat - $file > $tmp_file # Get header from main file, cat that header with split file contents to temp file
    mv -f $tmp_file $file # Overwrite non-header containing file with header-containing file
done

差异：

  1. in_file 是要拆分维护标题的文件参数

  2. 由于性能更好，awk因此使用tail`awk`

  3. 拆分为 100,000 行文件，而不是 4 行

  4. 分割文件名将是输入文件名附加下划线和数字（最多 99999 - 来自“-d -a 5”分割参数）

  5. 使用 mktemp 安全地处理临时文件

  6. 使用head | cat单行而不是双行

解决方案 11：

受到@Arkady 对一句话的评论的启发。

  • MYFILE 变量只是为了减少样板

  • split不显示文件名，但该--additional-suffix选项允许我们轻松控制预期内容

  • 通过删除中间文件rm $part（假设没有具有相同后缀的文件）

MYFILE=mycsv.csv && for part in $(split -n4 --additional-suffix=foo $MYFILE; ls *foo); do cat <(head -n1 $MYFILE) $part > $MYFILE.$part; rm $part; done

证据：

-rw-rw-r--  1 ec2-user ec2-user  32040108 Jun  1 23:18 mycsv.csv.xaafoo
-rw-rw-r--  1 ec2-user ec2-user  32040108 Jun  1 23:18 mycsv.csv.xabfoo
-rw-rw-r--  1 ec2-user ec2-user  32040108 Jun  1 23:18 mycsv.csv.xacfoo
-rw-rw-r--  1 ec2-user ec2-user  32040110 Jun  1 23:18 mycsv.csv.xadfoo

当然，还可以head -2 *foo看到标题被添加了。

解决方案 12：

一种简单但可能不那么优雅的方法：预先切断标题，拆分文件，然后使用 cat 或正在读取它的任何文件重新连接每个文件的标题。因此类似于：

  1. head -n1 文件.txt > 标题.txt

  2. 拆分-l 文件.txt

  3. 猫头.txt f1.txt

解决方案 13：

使用以下代码我得到了更好的结果，每个拆分文件都会有一个标题，并且生成的文件都会有一个规范化的名称。

export F=input.csv && LINES=3 &&\nexport PF="${F%.*}_" &&\nsplit -l $LINES "${F}" "${PF}" &&\nfor fn in $PF*
do
  mv "${fn}" "${fn}.csv"
done &&\nexport FILES=($PF*) && for file in "${FILES[@]:1}"
do
  head -n 1 "${F}" > tmp_file
  cat "$file" >> tmp_file
  mv -f tmp_file "${file}"
done

输出

$ wc -l input*
  22 input.csv
   3 input_aa.csv
   4 input_ab.csv
   4 input_ac.csv
   4 input_ad.csv
   4 input_ae.csv
   4 input_af.csv
   4 input_ag.csv
   2 input_ah.csv
  51 total

解决方案 14：

迟到了...

阅读完所有这些内容后，我将其添加到我的 bashrc 中：

split_csv_file() {
    _split_csv_filter() {
        { head -n 1 "${1}"; cat; } >| "$FILE";
    }
    export -f _split_csv_filter

    local file_name="${1##*/}"
    local file_base="${file_name%.*}"
    local chunks="${2}"
    echo "$file_name $file_base $chunks"
    tail -n +2 "${1}" | split -n l/"${chunks}" -d --filter="_split_csv_filter ${1}" - "${file_base}." --additional-suffix=.csv
}

这使我能够将# split_csv_file sample.csv 25csv 文件拆分成 25 个部分。感谢之前的所有回答，它们让我找到了这个非常方便的 bash 函数。

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