热图的第一行和最后一行被切成两半

2024-12-04 08:57:00
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摘要:问题描述:使用 seaborn 绘制热图(使用 matplotlib 绘制相关矩阵)时,第一行和最后一行被切成两半。当我运行这个在网上找到的最小代码示例时,也发生了这种情况。import pandas as pd import seaborn as sns import matplotlib.pyplot a...

问题描述:

使用 seaborn 绘制热图(使用 matplotlib 绘制相关矩阵)时,第一行和最后一行被切成两半。当我运行这个在网上找到的最小代码示例时,也发生了这种情况。

import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt

data = pd.read_csv('https://raw.githubusercontent.com/resbaz/r-novice-gapminder-files/master/data/gapminder-FiveYearData.csv')
plt.figure(figsize=(10,5))
sns.heatmap(data.corr())
plt.show()

并得到这个结果(我还不允许嵌入图像)
y 轴上的标签位于正确的位置,但行并不完全在那里。

几天前,它按预期工作。从那时起,我安装了 texlive-xetex,所以我再次删除了它,但这并没有解决我的问题。

知道我可能遗漏了什么吗?


解决方案 1:

不幸的是,matplotlib 3.1.1破坏了 seaborn 热图;并且通常反转轴并固定刻度。

这在当前开发版本中已修复;因此,您可能

  • 恢复到 matplotlib 3.1.0

  • 使用 matplotlib 3.1.2 或更高版本

  • 手动设置热图限制(ax.set_ylim(bottom, top) # set the ylim to bottom, top

解决方案 2:

这是 3.1.0 和 3.1.1 之间的 matplotlib 回归中的一个错误,您可以通过以下方式纠正它:

import seaborn as sns
df_corr = someDataFrame.corr()
ax = sns.heatmap(df_corr, annot=True) #notation: "annot" not "annote"
bottom, top = ax.get_ylim()
ax.set_ylim(bottom + 0.5, top - 0.5)

解决方案 3:

使用上述方法并手动设置热图限制进行修复。

第一的

ax = sns.heatmap(...

检查当前轴

ax.get_ylim()
(5.5, 0.5)

已修复

ax.set_ylim(6.0, 0)

解决方案 4:

我通过在我的代码中添加此行解决了这个问题matplotlib==3.1.1

ax.set_ylim(sorted(ax.get_xlim(), reverse=True))

注意:此方法有效的唯一原因是 x 轴未发生改变,因此使用未来 mpl 版本时风险自负

解决方案 5:

matplotlib 3.1.2 已发布 - 它可通过 conda-forge 在 Anaconda 云中使用,但我无法通过 conda install 安装它。手动替代方案有效:从 github 下载 matplotlib 3.1.2 并通过 pip 安装

 % curl https://codeload.github.com/matplotlib/matplotlib/tar.gz/v3.1.2 --output matplotlib-3.1.2.tar.gz
 % pip install matplotlib-3.1.2.tar.gz

解决方案 6:

对我有用:

b, t = plt.ylim()
b += 0.5
t -= 0.5
custom_ylim = (b, t)
plt.setp(axes, ylim=custom_ylim)

解决方案 7:

降级 matplotlib

!pip install matplotlib==3.1.0

并将此行添加到您的情节代码中:

ax[i].set_ylim(sorted(ax[i].get_xlim(), reverse=True))
 

解决方案 8:

它发生在 matplotlib 版本 3.1.1 中,正如importanceofbeingernest所建议的那样

以下解决了我的问题

pip install matplotlib==3.1.0

解决方案 9:

rustyDev 对 conda-forge 的看法是正确的,但我不需要从 github 下载手动进行 pip 安装。对我来说,在 Windows 上,它可以直接运行。而且图表又都很漂亮。

https://anaconda.org/conda-forge/matplotlib

conda install -c conda-forge matplotlib

可选要点,答案不需要:

之后,我尝试了其他步骤,但都不需要:在 conda 提示符中:conda search matplotlib --info 显示没有新版本信息,最新的信息是 3.1.1。因此我尝试使用 pippip install matplotlib==3.1.2但 pip 说“要求已经满足”

然后根据medium.com/@rakshithvasudev/…获取版本python - import matplotlib - matplotlib.__version__显示3.1.2已成功安装

顺便说一句,我在将 Spyder 更新到 v4.0.0 后立即遇到了此错误。错误出现在混淆矩阵的图中。几个月前已经提到过这一点。stackoverflow.com/questions/57225685/… 已经链接到这个 seaborn 问题。

解决方案 10:

正如 @ImportanceOfBeingErnest 提到的,此问题是由于特定版本的 matplotlib 中的 seaborn 热图损坏造成的,因此解决此问题的简单方法是升级 matplotlib,如下所示:

pip install --upgrade matplotlib
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