当 DISPLAY 未定义时使用 matplotlib 生成 PNG

问题描述：

我正在尝试将 networkx 与 Python 结合使用。当我运行此程序时，出现此错误。是否缺少了什么？

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")


Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 13, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

我现在收到一个不同的错误：

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

我现在收到一个不同的错误：

#!/usr/bin/env python

import networkx as nx
import matplotlib
import matplotlib.pyplot
import matplotlib.pyplot as plt

matplotlib.use('Agg')

G=nx.Graph()
G.add_node(1)
G.add_nodes_from([2,3,4,5,6,7,8,9,10])
#nx.draw_graphviz(G)
#nx_write_dot(G, 'node.png')
nx.draw(G)
plt.savefig("/var/www/node.png")

/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/__init__.py:835: UserWarning:  This call to matplotlib.use() has no effect
because the the backend has already been chosen;
matplotlib.use() must be called *before* pylab, matplotlib.pyplot,
or matplotlib.backends is imported for the first time.

  if warn: warnings.warn(_use_error_msg)
Traceback (most recent call last):
  File "graph.py", line 15, in <module>
    nx.draw(G)
  File "/usr/lib/python2.5/site-packages/networkx-1.2.dev-py2.5.egg/networkx/drawing/nx_pylab.py", line 124, in draw
    cf=pylab.gcf()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 276, in gcf
    return figure()
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/pyplot.py", line 254, in figure
    **kwargs)
  File "/usr/lib/pymodules/python2.5/matplotlib/backends/backend_tkagg.py", line 90, in new_figure_manager
    window = Tk.Tk()
  File "/usr/lib/python2.5/lib-tk/Tkinter.py", line 1650, in __init__
    self.tk = _tkinter.create(screenName, baseName, className, interactive, wantobjects, useTk, sync, use)
_tkinter.TclError: no display name and no $DISPLAY environment variable

解决方案 1：

主要问题是（在您的系统上）matplotlib 默认选择 x-using 后端。我刚刚在我的其中一台服务器上遇到了同样的问题。对我来说，解决方案是在任何其他 pylab/matplotlib/ pyplot导入之前读取的位置添加以下代码：

import matplotlib
# Force matplotlib to not use any Xwindows backend.
matplotlib.use('Agg')

另一种方法是将其设置为.matplotlibrc

解决方案 2：

只是作为 Reinout 回答的补充。

解决此类问题的永久方法是编辑 .matplotlibrc 文件。通过以下方式找到它

>>> import matplotlib  
>>> matplotlib.matplotlib_fname()
# This is the file location in Ubuntu
'/etc/matplotlibrc'

然后将该文件中的后端修改为backend : Agg。就是这样。

解决方案 3：

正确的答案是花一点时间正确准备您的执行环境。

准备执行环境的第一个技巧是使用matplotlibrc文件，正如 Chris Q. 明智推荐的那样，设置

backend : Agg

在该文件中。您甚至可以控制 — 无需更改代码 — matplotlib 如何以及在何处查找和找到该matplotlibrc文件。

准备执行环境的第二种技术是使用MPLBACKEND环境变量（并通知用户使用它）：

export MPLBACKEND="agg"
python <program_using_matplotlib.py>

这很方便，因为您甚至不必在磁盘上提供另一个文件即可完成此操作。例如，我已采用此方法进行持续集成测试，并在没有显示器的远程机器上运行。

在 Python 代码中将 matplotlib 后端硬编码为“Agg”就像用大锤将方形钉子砸入圆孔中，而您只需告诉 matplotlib 它需要是一个方形孔即可。

解决方案 4：

我在通过 Spark 使用 matplotlib 时遇到错误。matplotlib.use('Agg')对我来说不起作用。最后，以下代码对我有用。更多信息请见此处

import matplotlib.pyplot as plt.
plt.switch_backend('agg')

解决方案 5：

我只是重复@Ivo Bosticky 所说的内容，这些内容可以忽略。将这些行放在py 文件的最开头。

import matplotlib
matplotlib.use('Agg') 

或者会出错

*/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/__init__.py:923：UserWarning：对 matplotlib.use() 的调用无效
因为后端已经被选择了；
matplotlib.use() 必须在 pylab、matplotlib.pyplot 之前调用

这将解决所有显示问题

解决方案 6：

我发现此代码片段在 X 和非 X 环境之间切换时运行良好。

import os
import matplotlib as mpl
if os.environ.get('DISPLAY','') == '':
    print('no display found. Using non-interactive Agg backend')
    mpl.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

解决方案 7：

当登录服务器执行代码时请使用以下命令：

ssh -X username@servername

这-X将消除没有显示名称和没有 $DISPLAY 环境变量的错误

：）

解决方案 8：

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')
import matplotlib.pyplot as plt

它对我有用。

解决方案 9：

您使用的是哪种系统？您的系统似乎带有 X11，但 DISPLAY 环境变量未正确设置。尝试执行以下命令，然后重新运行您的程序：

export DISPLAY=localhost:0

解决方案 10：

另外要检查的是当前用户是否有权连接到 X 显示器。就我而言，root 不允许这样做，并且 matplotlib 也报了同样的错误。

user@debian:~$ xauth list         
debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1  ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xauth add debian/unix:10  MIT-MAGIC-COOKIE-1 ae921efd0026c6fc9d62a8963acdcca0
root@debian:~# xterm

来源：http ://www.debian-administration.org/articles/494 https://debian-administration.org/article/494/Getting_X11_forwarding_through_ssh_working_after_running_su

解决方案 11：

为了确保您的代码可在 Windows、Linux 和 OSX 以及带和不带显示器的系统上移植，我建议使用以下代码片段：

import matplotlib
import os
# must be before importing matplotlib.pyplot or pylab!
if os.name == 'posix' and "DISPLAY" not in os.environ:
    matplotlib.use('Agg')

# now import other things from matplotlib
import matplotlib.pyplot as plt

来源：https://stackoverflow.com/a/45756291/207661

解决方案 12：

对于 Google Cloud 机器学习引擎：

import matplotlib as mpl
mpl.use('Agg')
from matplotlib.backends.backend_pdf import PdfPages

然后打印到文件：

#PDF build and save
    def multi_page(filename, figs=None, dpi=200):
        pp = PdfPages(filename)
        if figs is None:
            figs = [mpl.pyplot.figure(n) for n in mpl.pyplot.get_fignums()]
        for fig in figs:
            fig.savefig(pp, format='pdf', bbox_inches='tight', fig_size=(10, 8))
        pp.close()

并创建 PDF：

multi_page(report_name)

解决方案 13：

import matplotlib
matplotlib.use('Agg')

只要我直接调用绘图函数/代码，它对我来说就有效。但是如果你使用

from joblib import Parallel, delayed

Parallel以及delayed用于并行化代码的模块，那么你需要添加

matplotlib.rcParams.update({'backend': 'Agg'})

在您的函数内部添加一行以使agg后端可以工作。