在 Pandas 中动态评估公式中的表达式
- 2024-12-25 08:51:00
- admin 原创
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问题描述:
我想使用 对一个或多个数据框列执行算术运算pd.eval
。具体来说,我想移植以下用于评估公式的代码:
x = 5
df2['D'] = df1['A'] + (df1['B'] * x)
...使用 进行编码pd.eval
。使用 的原因pd.eval
是我想自动化许多工作流程,因此动态创建它们对我很有用。
我的两个输入 DataFrames 是:
import pandas as pd
import numpy as np
np.random.seed(0)
df1 = pd.DataFrame(np.random.choice(10, (5, 4)), columns=list('ABCD'))
df2 = pd.DataFrame(np.random.choice(10, (5, 4)), columns=list('ABCD'))
df1
A B C D
0 5 0 3 3
1 7 9 3 5
2 2 4 7 6
3 8 8 1 6
4 7 7 8 1
df2
A B C D
0 5 9 8 9
1 4 3 0 3
2 5 0 2 3
3 8 1 3 3
4 3 7 0 1
我正在尝试更好地理解pd.eval
和engine
论据parser
,以确定如何最好地解决我的问题。我已阅读文档,但差异并没有向我说明清楚。
应该使用什么参数来确保我的代码以最佳性能运行?
有没有办法将表达式的结果赋回给
df2
?此外,为了使事情变得更加复杂,我如何
x
在字符串表达式中传递参数?
解决方案 1:
您可以使用 1) pd.eval()
、 2)df.query()
或 3)df.eval()
。下面讨论它们的各种特性和功能。
示例将涉及这些数据框(除非另有说明)。
np.random.seed(0)
df1 = pd.DataFrame(np.random.choice(10, (5, 4)), columns=list('ABCD'))
df2 = pd.DataFrame(np.random.choice(10, (5, 4)), columns=list('ABCD'))
df3 = pd.DataFrame(np.random.choice(10, (5, 4)), columns=list('ABCD'))
df4 = pd.DataFrame(np.random.choice(10, (5, 4)), columns=list('ABCD'))
1)pandas.eval
这是 pandas doc 应该包含的“缺失手册”。
注意:在讨论的三个函数中,pd.eval
是最重要的。df.eval
并在后台df.query
调用pd.eval
。这三个函数的行为和用法大致一致,但有一些细微的语义差异,稍后将重点介绍。本节将介绍这三个函数共有的功能 - 包括(但不限于)允许的语法、优先规则和关键字参数。
pd.eval
可以计算由变量和/或文字组成的算术表达式。这些表达式必须以字符串形式传递。因此,要回答上述问题,您可以这样做
x = 5
pd.eval("df1.A + (df1.B * x)")
这里需要注意以下几点:
整个表达式是一个字符串
df1
、df2
和引用全局命名空间中的变量,这些变量在解析表达式时x
被获取eval
使用属性访问器索引来访问特定列。您也可以使用
"df1['A'] + (df1['B'] * x)"
相同的效果。
我将在下面解释属性的部分中解决重新分配的具体问题target=...
。但现在,这里有更多使用 的有效操作的简单示例pd.eval
:
pd.eval("df1.A + df2.A") # Valid, returns a pd.Series object
pd.eval("abs(df1) ** .5") # Valid, returns a pd.DataFrame object
...等等。条件表达式也以同样的方式得到支持。以下语句都是有效的表达式,将由引擎进行评估。
pd.eval("df1 > df2")
pd.eval("df1 > 5")
pd.eval("df1 < df2 and df3 < df4")
pd.eval("df1 in [1, 2, 3]")
pd.eval("1 < 2 < 3")
可以在文档中找到所有支持的功能和语法的详细列表。总而言之,
除左移 (
<<
) 和右移 (>>
) 运算符之外的算术运算,例如df + 2 * pi / s ** 4 % 42
- the_golden_ratio比较操作,包括链式比较,例如
2 < df < df2
布尔运算(例如或
df < df2 and df3 < df4
)not df_bool
list
和tuple
文字(例如[1, 2]
或(1, 2)
属性访问,例如
df.a
下标表达式,例如,
df[0]
简单变量评估,例如
pd.eval('df')
(这不是很有用)数学函数:sin、cos、exp、log、expm1、log1p、sqrt、sinh、cosh、tanh、arcsin、arccos、arctan、arccosh、arcsinh、arctanh、abs 和 arctan2。
本部分文档还指定了不支持的语法规则,包括set
/dict
文字、if-else 语句、循环和理解以及生成器表达式。
从列表中可以明显看出,您还可以传递涉及索引的表达式,例如
pd.eval('df1.A * (df1.index > 1)')
1a)解析器选择:parser=...
论点
pd.eval
在解析表达式字符串以生成语法树时,支持两种不同的解析器选项:pandas
和python
。两者之间的主要区别在于略有不同的优先规则。
使用默认解析器pandas
,重载的按位运算符&
和(使用 pandas 对象实现矢量化的 AND 和 OR 运算)将具有与and|
相同的运算符优先级。因此,and
`or`
pd.eval("(df1 > df2) & (df3 < df4)")
将与
pd.eval("df1 > df2 & df3 < df4")
# pd.eval("df1 > df2 & df3 < df4", parser='pandas')
也和
pd.eval("df1 > df2 and df3 < df4")
这里,括号是必需的。按照惯例,需要使用括号来覆盖位运算符的较高优先级:
(df1 > df2) & (df3 < df4)
如果没有这个,我们最终会得到
df1 > df2 & df3 < df4
ValueError: The truth value of a DataFrame is ambiguous. Use a.empty, a.bool(), a.item(), a.any() or a.all().
parser='python'
如果您想在评估字符串时与 python 的实际运算符优先规则保持一致,请使用。
pd.eval("(df1 > df2) & (df3 < df4)", parser='python')
两种解析器之间的另一个区别是带有列表和元组节点的==
and运算符的语义,在使用解析器时,它们分别具有与and!=
类似的语义。例如,in
`not in`'pandas'
pd.eval("df1 == [1, 2, 3]")
有效,并将以与以下相同的语义运行
pd.eval("df1 in [1, 2, 3]")
另一方面,pd.eval("df1 == [1, 2, 3]", parser='python')
会引发NotImplementedError
错误。
1b)后端选择:engine=...
论点
有两个选项 - numexpr
(默认)和python
。该numexpr
选项使用针对性能进行了优化的numexpr后端。
使用 Python 后端,表达式的求值方式类似于将表达式传递给 Pythoneval
函数。您可以灵活地在表达式内部执行更多操作,例如字符串操作。
df = pd.DataFrame({'A': ['abc', 'def', 'abacus']})
pd.eval('df.A.str.contains("ab")', engine='python')
0 True
1 False
2 True
Name: A, dtype: bool
不幸的是,这种方法与引擎相比没有任何性能优势numexpr
,而且几乎没有安全措施来确保不评估危险的表达式,因此请自行承担风险!通常不建议将此选项更改为,'python'
除非您知道自己在做什么。
1c)local_dict
和global_dict
论点
有时,为表达式中使用的变量提供值很有用,但变量目前未在命名空间中定义。您可以将字典传递给local_dict
例如:
pd.eval("df1 > thresh")
UndefinedVariableError: name 'thresh' is not defined
thresh
由于未定义,因此失败。但是,以下方法有效:
pd.eval("df1 > thresh", local_dict={'thresh': 10})
当你需要从字典中提供变量时,这很有用。或者,使用 Python 引擎,你可以简单地执行以下操作:
mydict = {'thresh': 5}
# Dictionary values with *string* keys cannot be accessed without
# using the 'python' engine.
pd.eval('df1 > mydict["thresh"]', engine='python')
但这可能比使用引擎并将字典传递给或慢得多。希望这可以为使用这些参数提供令人信服的论据。'numexpr'
`local_dict`global_dict
1d) target
(+ inplace
) 参数和赋值表达式
这通常不是一个要求,因为通常有更简单的方法可以做到这一点,但你可以将结果分配给实现诸如s 和(你猜对了)DataFrames 的pd.eval
对象。__getitem__
`dict`
考虑问题中的例子
x = 5 df2['D'] = df1['A'] + (df1['B'] * x)
要将“D”列分配df2
给
pd.eval('D = df1.A + (df1.B * x)', target=df2)
A B C D
0 5 9 8 5
1 4 3 0 52
2 5 0 2 22
3 8 1 3 48
4 3 7 0 42
这不是就地修改df2
(但可以……继续阅读)。考虑另一个例子:
pd.eval('df1.A + df2.A')
0 10
1 11
2 7
3 16
4 10
dtype: int32
如果您想要(例如)将其分配回 DataFrame,则可以按target
如下方式使用参数:
df = pd.DataFrame(columns=list('FBGH'), index=df1.index)
df
F B G H
0 NaN NaN NaN NaN
1 NaN NaN NaN NaN
2 NaN NaN NaN NaN
3 NaN NaN NaN NaN
4 NaN NaN NaN NaN
df = pd.eval('B = df1.A + df2.A', target=df)
# Similar to
# df = df.assign(B=pd.eval('df1.A + df2.A'))
df
F B G H
0 NaN 10 NaN NaN
1 NaN 11 NaN NaN
2 NaN 7 NaN NaN
3 NaN 16 NaN NaN
4 NaN 10 NaN NaN
如果您想要对 执行就地变异df
,请设置inplace=True
。
pd.eval('B = df1.A + df2.A', target=df, inplace=True)
# Similar to
# df['B'] = pd.eval('df1.A + df2.A')
df
F B G H
0 NaN 10 NaN NaN
1 NaN 11 NaN NaN
2 NaN 7 NaN NaN
3 NaN 16 NaN NaN
4 NaN 10 NaN NaN
如果inplace
设置了但没有目标,ValueError
则会提高。
尽管这个target
论点很有趣,但你很少需要使用它。
如果您想要使用 来执行此操作df.eval
,则可以使用涉及赋值的表达式:
df = df.eval("B = @df1.A + @df2.A")
# df.eval("B = @df1.A + @df2.A", inplace=True)
df
F B G H
0 NaN 10 NaN NaN
1 NaN 11 NaN NaN
2 NaN 7 NaN NaN
3 NaN 16 NaN NaN
4 NaN 10 NaN NaN
笔记
的一个pd.eval
非预期用途是以与非常相似的方式解析文字字符串ast.literal_eval
:
pd.eval("[1, 2, 3]")
array([1, 2, 3], dtype=object)
它还可以使用'python'
引擎解析嵌套列表:
pd.eval("[[1, 2, 3], [4, 5], [10]]", engine='python')
[[1, 2, 3], [4, 5], [10]]
以及字符串列表:
pd.eval(["[1, 2, 3]", "[4, 5]", "[10]"], engine='python')
[[1, 2, 3], [4, 5], [10]]
然而,问题在于长度大于 100 的列表:
pd.eval(["[1]"] * 100, engine='python') # Works
pd.eval(["[1]"] * 101, engine='python')
AttributeError: 'PandasExprVisitor' object has no attribute 'visit_Ellipsis'
您可以在此处找到有关此错误、原因、修复和解决方法的更多信息。
2)DataFrame.eval
:
如上所述,在后台df.eval
调用pd.eval
,并带有一些参数并列。v0.23源代码显示了这一点:
def eval(self, expr, inplace=False, **kwargs):
from pandas.core.computation.eval import eval as _eval
inplace = validate_bool_kwarg(inplace, 'inplace')
resolvers = kwargs.pop('resolvers', None)
kwargs['level'] = kwargs.pop('level', 0) + 1
if resolvers is None:
index_resolvers = self._get_index_resolvers()
resolvers = dict(self.iteritems()), index_resolvers
if 'target' not in kwargs:
kwargs['target'] = self
kwargs['resolvers'] = kwargs.get('resolvers', ()) + tuple(resolvers)
return _eval(expr, inplace=inplace, **kwargs)
eval
创建参数,进行一些验证,然后将参数传递给pd.eval
。
有关更多信息,您可以继续阅读:何时使用 DataFrame.eval() 与 pandas.eval() 或 Python eval()
2a)使用差异
2a1) DataFrames 表达式与系列表达式
对于与整个 DataFrames 相关的动态查询,您应该选择。例如,当您调用或 时,pd.eval
没有简单的方法来指定 的等效项。pd.eval("df1 + df2")
`df1.eval`df2.eval
2a2)指定列名
另一个主要区别是如何访问列。例如,要在中添加两列“A”和“B” df1
,您可以pd.eval
使用以下表达式调用:
pd.eval("df1.A + df1.B")
使用 df.eval,您只需提供列名:
df1.eval("A + B")
因为,在的上下文中df1
,很明显“A”和“B”指的是列名。
您还可以使用来引用索引和列index
(除非索引已命名,在这种情况下您将使用该名称)。
df1.eval("A + index")
或者,更一般地,对于任何具有 1 个或多个级别的索引的 DataFrame,您可以在表达式中使用变量“ilevel_k”引用索引的第k 级,该变量代表“第k 级索引”。换句话说,上面的表达式可以写成。df1.eval("A + ilevel_0")
这些规则也适用于df.query
。
2a3)访问本地/全局命名空间中的变量
表达式内部提供的变量前面必须有“@”符号,以避免与列名混淆。
A = 5
df1.eval("A > @A")
也一样query
。
毋庸置疑,您的列名必须遵循 Python 中有效标识符命名的规则,才能在 中访问eval
。请参阅此处了解有关命名标识符的规则列表。
2a4)多行查询和赋值
一个鲜为人知的事实是,eval
支持处理赋值的多行表达式(而不query
支持)。例如,要根据对某些列的一些算术运算在 df1 中创建两个新列“E”和“F”,并根据之前创建的“E”和“F”创建第三列“G”,我们可以这样做
df1.eval("""
E = A + B
F = @df2.A + @df2.B
G = E >= F
""")
A B C D E F G
0 5 0 3 3 5 14 False
1 7 9 3 5 16 7 True
2 2 4 7 6 6 5 True
3 8 8 1 6 16 9 True
4 7 7 8 1 14 10 True
3)eval
对比query
将其视为一个用作子程序df.query
的函数会有所帮助。pd.eval
通常,query
(顾名思义)用于评估条件表达式(即结果为 True/False 值的表达式)并返回与结果对应的行True
。然后将表达式的结果传递给loc
(大多数情况下)以返回满足表达式的行。根据文档,
该表达式的评估结果首先传递给
DataFrame.loc
,如果由于多维键(例如 DataFrame)而失败,则结果将传递给DataFrame.__getitem__()
。此方法使用顶级
pandas.eval()
函数来评估传递的查询。
就相似性而言,query
和df.eval
在访问列名和变量的方式上是相似的。
如上所述,两者之间的关键区别在于它们如何处理表达式结果。当您实际通过这两个函数运行表达式时,这一点变得显而易见。例如,考虑
df1.A
0 5
1 7
2 2
3 8
4 7
Name: A, dtype: int32
df1.B
0 9
1 3
2 0
3 1
4 7
Name: B, dtype: int32
为了获取其中“A”> =“B”的所有行,我们可以这样df1
使用:eval
m = df1.eval("A >= B")
m
0 True
1 False
2 False
3 True
4 True
dtype: bool
m
表示对表达式“A >= B”求值后生成的中间结果。然后我们使用掩码进行过滤df1
:
df1[m]
# df1.loc[m]
A B C D
0 5 0 3 3
3 8 8 1 6
4 7 7 8 1
但是,使用query
,中间结果“m”直接传递给loc
,因此使用query
,您只需执行
df1.query("A >= B")
A B C D
0 5 0 3 3
3 8 8 1 6
4 7 7 8 1
从性能角度来看,它是完全相同的。
df1_big = pd.concat([df1] * 100000, ignore_index=True)
%timeit df1_big[df1_big.eval("A >= B")]
%timeit df1_big.query("A >= B")
14.7 ms ± 33.9 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
14.7 ms ± 24.3 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)
但后者更简洁,只需一步即可表达相同的操作。
请注意,您还可以这样做奇怪的事情query
(例如,返回由 df1.index 索引的所有行)
df1.query("index")
# Same as df1.loc[df1.index] # Pointless,... I know
A B C D
0 5 0 3 3
1 7 9 3 5
2 2 4 7 6
3 8 8 1 6
4 7 7 8 1
但不要这样。
底线:请query
在根据条件表达式查询或过滤行时使用。
解决方案 2:
目前已经有了很好的教程,但是请记住,在疯狂地使用它之前eval/query
,如果它的语法更简单,那么如果你的数据集少于 15,000 行,它会出现严重的性能问题。
在这种情况下,只需使用df.loc[mask1, mask2]
。
参考:通过 eval() 进行表达式求值