如何从包含列表的 Pandas 列中进行独热编码？
- 2025-02-25 09:07:00
- admin 原创
- 25
问题描述：
我想将由元素列表组成的 pandas 列分解为与唯一元素数量相同的列（即one-hot-encode它们）（其值1表示行中存在的给定元素以及0不存在的情况）。
例如，取数据框df
Col1 Col2 Col3
C 33 [Apple, Orange, Banana]
A 2.5 [Apple, Grape]
B 42 [Banana]
我想将其转换为：
自由度
Col1 Col2 Apple Orange Banana Grape
C 33 1 1 1 0
A 2.5 1 0 0 1
B 42 0 0 1 0
我如何使用 pandas/sklearn 来实现这一点？
解决方案 1：
我们还可以使用sklearn.preprocessing.MultiLabelBinarizer：
为了节省大量的 RAM，我们常常想使用稀疏DataFrame 来存储真实世界的数据。
稀疏解决方案（适用于 Pandas v0.25.0+）
from sklearn.preprocessing import MultiLabelBinarizer
mlb = MultiLabelBinarizer(sparse_output=True)
df = df.join(
pd.DataFrame.sparse.from_spmatrix(
mlb.fit_transform(df.pop('Col3')),
index=df.index,
columns=mlb.classes_))
结果：
In [38]: df
Out[38]:
Col1 Col2 Apple Banana Grape Orange
0 C 33.0 1 1 0 1
1 A 2.5 1 0 1 0
2 B 42.0 0 1 0 0
In [39]: df.dtypes
Out[39]:
Col1 object
Col2 float64
Apple Sparse[int32, 0]
Banana Sparse[int32, 0]
Grape Sparse[int32, 0]
Orange Sparse[int32, 0]
dtype: object
In [40]: df.memory_usage()
Out[40]:
Index 128
Col1 24
Col2 24
Apple 16 # <--- NOTE!
Banana 16 # <--- NOTE!
Grape 8 # <--- NOTE!
Orange 8 # <--- NOTE!
dtype: int64
稠密溶液
mlb = MultiLabelBinarizer()
df = df.join(pd.DataFrame(mlb.fit_transform(df.pop('Col3')),
columns=mlb.classes_,
index=df.index))
结果：
In [77]: df
Out[77]:
Col1 Col2 Apple Banana Grape Orange
0 C 33.0 1 1 0 1
1 A 2.5 1 0 1 0
2 B 42.0 0 1 0 0
解决方案 2：
选项 1
简答
pir_slow
df.drop('Col3', 1).join(df.Col3.str.join('|').str.get_dummies())
Col1 Col2 Apple Banana Grape Orange
0 C 33.0 1 1 0 1
1 A 2.5 1 0 1 0
2 B 42.0 0 1 0 0
选项 2
快速答案
pir_fast
v = df.Col3.values
l = [len(x) for x in v.tolist()]
f, u = pd.factorize(np.concatenate(v))
n, m = len(v), u.size
i = np.arange(n).repeat(l)
dummies = pd.DataFrame(
np.bincount(i * m + f, minlength=n * m).reshape(n, m),
df.index, u
)
df.drop('Col3', 1).join(dummies)
Col1 Col2 Apple Orange Banana Grape
0 C 33.0 1 1 1 0
1 A 2.5 1 0 0 1
2 B 42.0 0 0 1 0
选项 3
pir_alt1
df.drop('Col3', 1).join(
pd.get_dummies(
pd.DataFrame(df.Col3.tolist(), df.index).stack()
).astype(int).groupby(level=0).sum()
)
Col1 Col2 Apple Orange Banana Grape
0 C 33.0 1 1 1 0
1 A 2.5 1 0 0 1
2 B 42.0 0 0 1 0
计时结果
代码如下
def maxu(df):
mlb = MultiLabelBinarizer()
d = pd.DataFrame(
mlb.fit_transform(df.Col3.values)
, df.index, mlb.classes_
)
return df.drop('Col3', 1).join(d)
def bos(df):
return df.drop('Col3', 1).assign(**pd.get_dummies(df.Col3.apply(lambda x:pd.Series(x)).stack().reset_index(level=1,drop=True)).sum(level=0))
def psi(df):
return pd.concat([
df.drop("Col3", 1),
df.Col3.apply(lambda x: pd.Series(1, x)).fillna(0)
], axis=1)
def alex(df):
return df[['Col1', 'Col2']].assign(**{fruit: [1 if fruit in cell else 0 for cell in df.Col3]
for fruit in set(fruit for fruits in df.Col3
for fruit in fruits)})
def pir_slow(df):
return df.drop('Col3', 1).join(df.Col3.str.join('|').str.get_dummies())
def pir_alt1(df):
return df.drop('Col3', 1).join(pd.get_dummies(pd.DataFrame(df.Col3.tolist()).stack()).astype(int).sum(level=0))
def pir_fast(df):
v = df.Col3.values
l = [len(x) for x in v.tolist()]
f, u = pd.factorize(np.concatenate(v))
n, m = len(v), u.size
i = np.arange(n).repeat(l)
dummies = pd.DataFrame(
np.bincount(i * m + f, minlength=n * m).reshape(n, m),
df.index, u
)
return df.drop('Col3', 1).join(dummies)
results = pd.DataFrame(
index=(1, 3, 10, 30, 100, 300, 1000, 3000),
columns='maxu bos psi alex pir_slow pir_fast pir_alt1'.split()
)
for i in results.index:
d = pd.concat([df] * i, ignore_index=True)
for j in results.columns:
stmt = '{}(d)'.format(j)
setp = 'from __main__ import d, {}'.format(j)
results.set_value(i, j, timeit(stmt, setp, number=10))
解决方案 3：
方法 1使用explode（版本 0.25.0 中的新功能）和crosstab：
s = df['Col3'].explode()
df[['Col1', 'Col2']].join(pd.crosstab(s.index, s))
或者在 Python 3.7+ 中：
df[['Col1', 'Col2']].join(pd.crosstab((s:=df['Col3'].explode()).index, s))
方法 2使用isin：
from itertools import chain
lst = sorted(set(chain.from_iterable(df['Col3'])))
s = pd.Series(lst, index=lst)
df.join(df.pop('Col3').apply(lambda x: s.isin(x)).astype(int))
输出：
Col1 Col2 Apple Banana Grape Orange
0 C 33.0 1 1 0 1
1 A 2.5 1 0 1 0
2 B 42.0 0 1 0 0
解决方案 4：
使用get_dummies：
df_out = df.assign(**pd.get_dummies(df.Col3.apply(lambda x:pd.Series(x)).stack().reset_index(level=1,drop=True)).sum(level=0))
输出：
Col1 Col2 Col3 Apple Banana Grape Orange
0 C 33.0 [Apple, Orange, Banana] 1 1 0 1
1 A 2.5 [Apple, Grape] 1 0 1 0
2 B 42.0 [Banana] 0 1 0 0
清理柱：
df_out.drop('Col3',axis=1)
输出：
Col1 Col2 Apple Banana Grape Orange
0 C 33.0 1 1 0 1
1 A 2.5 1 0 1 0
2 B 42.0 0 1 0 0
解决方案 5：
您可以循环Col3并将apply每个元素转换为系列，以列表作为索引，成为结果数据框中的标题：
pd.concat([
df.drop("Col3", 1),
df.Col3.apply(lambda x: pd.Series(1, x)).fillna(0)
], axis=1)
#Col1 Col2 Apple Banana Grape Orange
#0 C 33.0 1.0 1.0 0.0 1.0
#1 A 2.5 1.0 0.0 1.0 0.0
#2 B 42.0 0.0 1.0 0.0 0.0
解决方案 6：
您可以使用集合推导来获取所有独特的水果，Col3如下所示：
set(fruit for fruits in df.Col3 for fruit in fruits)
使用字典理解，您可以浏览每种独特的水果并查看它是否在列中。
>>> df[['Col1', 'Col2']].assign(**{fruit: [1 if fruit in cell else 0 for cell in df.Col3]
for fruit in set(fruit for fruits in df.Col3
for fruit in fruits)})
Col1 Col2 Apple Banana Grape Orange
0 C 33.0 1 1 0 1
1 A 2.5 1 0 1 0
2 B 42.0 0 1 0 0
时间安排
dfs = pd.concat([df] * 1000) # Use 3,000 rows in the dataframe.
# Solution 1 by @Alexander (me)
%%timeit -n 1000
dfs[['Col1', 'Col2']].assign(**{fruit: [1 if fruit in cell else 0 for cell in dfs.Col3]
for fruit in set(fruit for fruits in dfs.Col3 for fruit in fruits)})
# 10 loops, best of 3: 4.57 ms per loop
# Solution 2 by @Psidom
%%timeit -n 1000
pd.concat([
dfs.drop("Col3", 1),
dfs.Col3.apply(lambda x: pd.Series(1, x)).fillna(0)
], axis=1)
# 10 loops, best of 3: 748 ms per loop
# Solution 3 by @MaxU
from sklearn.preprocessing import MultiLabelBinarizer
mlb = MultiLabelBinarizer()
%%timeit -n 10
dfs.join(pd.DataFrame(mlb.fit_transform(dfs.Col3),
columns=mlb.classes_,
index=dfs.index))
# 10 loops, best of 3: 283 ms per loop
# Solution 4 by @ScottBoston
%%timeit -n 10
df_out = dfs.assign(**pd.get_dummies(dfs.Col3.apply(lambda x:pd.Series(x)).stack().reset_index(level=1,drop=True)).sum(level=0))
# 10 loops, best of 3: 512 ms per loop
But...
>>> print(df_out.head())
Col1 Col2 Col3 Apple Banana Grape Orange
0 C 33.0 [Apple, Orange, Banana] 1000 1000 0 1000
1 A 2.5 [Apple, Grape] 1000 0 1000 0
2 B 42.0 [Banana] 0 1000 0 0
0 C 33.0 [Apple, Orange, Banana] 1000 1000 0 1000
1 A 2.5 [Apple, Grape] 1000 0 1000 0
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